Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms