Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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