Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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