Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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