Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KRTAP1-5Q9BYS1 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms