Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CSMD2-204ENST00000373380 4379 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMF1-203ENST00000335877 4290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL2-207ENST00000614342 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP12-201ENST00000324134 3801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TDRD1-203ENST00000369282 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX53-201ENST00000327968 3629 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EXT2-201ENST00000343631 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NAGA-202ENST00000402937 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHAC1-202ENST00000409700 4077 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SIM1-201ENST00000262901 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB4-206ENST00000453593 3699 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR137HG-205ENST00000634594 3586 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM196A-203ENST00000614311 4335 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX35-203ENST00000373325 3287 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRF4-203ENST00000371220 3075 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HAL-201ENST00000261208 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AK5-202ENST00000344720 3929 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RPGR-203ENST00000378505 4767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LCN1P1-201ENST00000372031 505 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR922-201ENST00000401223 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1208-201ENST00000408334 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP203-201ENST00000410451 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL450311.1-201ENST00000434931 576 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PHBP13-201ENST00000453244 760 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL465P-201ENST00000468411 301 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL745P-201ENST00000484900 299 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG1L12P-201ENST00000515046 434 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHVII-1-1-201ENST00000517907 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC067930.2-201ENST00000529247 431 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-AS2-201ENST00000545526 609 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1OR16-1-201ENST00000568055 392 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-P-207ENST00000568192 747 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008687.3-201ENST00000599209 598 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LYPLA2P2-201ENST00000600506 676 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.169-201ENST00000613708 283 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RIN1-208ENST00000627248 243 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233724.17-201ENST00000639073 597 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms