Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDKN3Q16667 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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