Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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