Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms