Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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