Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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