Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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PKP1Q13835 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PKP1Q13835 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PKP1Q13835 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PKP1Q13835 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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