Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C1orf61Q13536 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms