Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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SP140Q13342 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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