Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms