Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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TRAF1Q13077 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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