Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRDNQ13061 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRDNQ13061 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRDNQ13061 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRDNQ13061 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TRDNQ13061 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRDNQ13061 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRDNQ13061 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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