Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNTN1Q12860 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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CNTN1Q12860 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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CNTN1Q12860 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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