Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms