Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 EZR-AS1-201ENST00000451712 217 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD11P31277 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD11P31277 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD11P31277 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD11P31277 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD11P31277 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD11P31277 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD11P31277 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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HOXD11P31277 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CCDC144B-201ENST00000285176 4310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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