Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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PTPREP23469 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PTPREP23469 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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