Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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