Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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