Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP35Q9P2H5 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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