Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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LHX9Q9NQ69 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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LHX9Q9NQ69 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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LHX9Q9NQ69 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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