Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC134684.1-201ENST00000533883 264 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC156455.1-202ENST00000540968 587 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC093249.3-201ENST00000562444 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 uc_338.35-201ENST00000616802 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NTPCR-202ENST00000366628 6311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LIMCH1-205ENST00000503057 5467 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC38A4-202ENST00000447411 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRAF1-202ENST00000540010 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 KCNMA1-228ENST00000638223 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC240565.2-201ENST00000623180 2096 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADGRF4-201ENST00000283303 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MCTP1-202ENST00000429576 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC023300.3-201ENST00000623096 5025 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAGI2-236ENST00000637441 5822 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 COL3A1-202ENST00000317840 3873 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ENTPD7-201ENST00000370489 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TJAP1-215ENST00000612912 4312 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM196A-203ENST00000614311 4335 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PPM1L-202ENST00000464260 2735 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYH13-202ENST00000418404 6067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LY9-201ENST00000263285 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF585A-203ENST00000392157 3190 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CD2BP2-201ENST00000305596 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 E2F8-202ENST00000527884 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP004782.1-201ENST00000623990 3433 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 EYA1-201ENST00000303824 3930 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PSME3-201ENST00000293362 3144 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYRIP-210ENST00000539167 4635 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms