Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED9Q6R2W3 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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