Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RSPH4AQ5TD94 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RSPH4AQ5TD94 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RSPH4AQ5TD94 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RSPH4AQ5TD94 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RSPH4AQ5TD94 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RSPH4AQ5TD94 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
RSPH4AQ5TD94 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RSPH4AQ5TD94 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms