Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PCBP1-AS1-244ENST00000594376 1197 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC024901.1-201ENST00000535764 718 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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ANKRD39Q53RE8 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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ANKRD39Q53RE8 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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ANKRD39Q53RE8 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 UCMA-201ENST00000378681 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39Q53RE8 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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