Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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DDB1Q16531 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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DDB1Q16531 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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DDB1Q16531 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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DDB1Q16531 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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