Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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