Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SHPRHQ149N8 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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