Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms