Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SSPNQ14714 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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