Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RUNX3Q13761 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms