Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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