Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms