Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SMAD4Q13485 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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