Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RPS12P20-201ENST00000464109 380 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE2V1Q13404 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms