Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDE3BQ13370 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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