Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SP140Q13342 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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