Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms