Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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NME3Q13232 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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NME3Q13232 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NME3Q13232 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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