Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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