Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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