Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZNF608Q9ULD9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF608Q9ULD9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms