Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GGA1Q9UJY5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms