Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA3Q9UI47 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms