Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MLH3Q9UHC1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MLH3Q9UHC1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms