Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK4Q9UBT3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms